Le microbiote intestinal est un écosystème complexe de milliers de bactéries, champignons et autres microorganismes qui vivent dans notre système digestif.

Il joue un rôle clé dans la digestion, l’immunité, la production de vitamines et même la régulation de l’humeur et du métabolisme.

Une grande diversité bactérienne est généralement associée à une meilleure santé globale, tandis qu’une faible diversité est liée à des troubles métaboliques, immunitaires ou digestifs.

La question de savoir si la musculation, c’est-à-dire un entraînement de force impliquant des contractions musculaires répétées peut remodeler cette communauté microbienne repose sur la manière dont l’exercice influence les mécanismes physiologiques qui affectent également l’intestin.

Dans une étude récente présentée par Sci-Sport, un groupe de participants sédentaires a suivi un programme de musculation régulier sur huit semaines.

À la fin de cette période, les chercheurs ont observé une augmentation significative de la force musculaire des participants, ce qui confirme l’efficacité du programme d’entraînement.

Cependant, lorsqu’ils ont analysé la composition du microbiote intestinal, ils n’ont pas noté de changement significatif dans la diversité bactérienne ou les profils de composition générale du microbiote.

Cela suggère que, à court terme, la musculation ne remodèle pas radicalement le microbiote intestinal de manière évidente.

Plus précisément, ni la richesse des espèces bactériennes ni la diversité alpha (mesure de la variété des bactéries au sein d’un individu) n’ont montré de modifications marquées avant et après l’entraînement. De même, l’analyse métabolomique des selles qui évalue les produits chimiques produits par le microbiome est restée globalement stable.

Cela ne signifie pas que l’exercice n’a aucun effet sur la santé intestinale, mais plutôt que la musculation seule, en tant que type d’exercice isolé, n’a pas entraîné de changements profonds dans le microbiome mesuré à ce niveau et sur une courte période.

Cette conclusion nuance une idée parfois répandue selon laquelle plus d’exercice équivaut automatiquement à un microbiote plus sain.

Même si les données directes sur la musculation sont encore limitées, il existe de nombreuses preuves scientifiques indiquant que l’exercice physique en général peut modifier le microbiote, mais d’une manière qui dépend du type, de l’intensité et de la durée de l’activité.

Par exemple, des exercices modérés combinant endurance et force sont associés à une augmentation de la diversité bactérienne, à une meilleure production d’acides gras à chaîne courte (SCFA), ainsi qu’à une réduction de l’inflammation systémique.

Les SCFA, produits par certaines bactéries bénéfiques, jouent un rôle clé dans le métabolisme énergétique, la modulation immunitaire et l’intégrité de la barrière intestinale.

Plus ces métabolites sont présents, plus le microbiote est considéré comme favorable à la santé globale.

Dans le cas des athlètes ou des individus actifs, des niveaux plus élevés de SCFA ont été corrélés à une meilleure performance musculaire et à une récupération plus rapide.

La musculation, bien qu’elle puisse n’avoir qu’un impact limité direct sur le microbiote, influence néanmoins l’organisme de manière systémique : elle libère des myokines; des molécules produites par les muscles en contraction qui peuvent interagir avec d’autres organes, stimuler le métabolisme et moduler la réponse immunitaire.

Ce type de signalisation, indirectement, peut jouer un rôle dans la communication entre l’intestin et les tissus périphériques.

Dans la réalité, peu de personnes se contentent de faire de la musculation isolée sans autre forme d’activité physique ni modification de leurs habitudes alimentaires.

Or, le microbiote est extrêmement sensible à l’alimentation, tout particulièrement à la consommation de fibres, de prébiotiques et de probiotiques. Des régimes riches en aliments fermentés, en légumes et en fibres ont montré des effets bénéfiques sur la diversité bactérienne.

De plus, combiner musculation avec des activités cardiovasculaires (comme la marche rapide, le vélo ou la natation) semble favoriser un effet plus prononcé sur le microbiote que l’un ou l’autre exercice pris isolément.

Une combinaison d’entraînement peut stimuler la circulation sanguine, réduire l’inflammation et optimiser l’environnement intestinal, même si ces mécanismes ne sont pas encore entièrement compris.

Il est important de souligner que les réponses du microbiote à l’exercice varient énormément d’une personne à l’autre. L’intensité, la durée, l’âge, le régime alimentaire, le niveau de stress et même la composition de départ du microbiote influencent les résultats.

Par exemple, une activité physique intense et prolongée peut augmenter la perméabilité intestinale et provoquer une inflammation transitoire, alors que des exercices réguliers et modérés semblent favoriser un profil bactérien plus équilibré et riche.

De nombreuses études montrent que les athlètes d’endurance ont souvent une diversité bactérienne plus élevée que les populations sédentaires, probablement parce qu’ils associent volume d’entraînement élevé avec une alimentation riche en nutriments, fibres et antioxydants.

Ce que la science commence à dessiner n’est pas une réponse simple du type « la musculation remodèle le microbiote », mais plutôt une image plus nuancée : l’activité physique influence le microbiome intestinal dans le cadre d’un ensemble de facteurs liés au mode de vie : alimentation, types d’entraînement, récupération, stress et sommeil.

Cela signifie que, pour optimiser la santé intestinale, il est préférable d’adopter une approche globale, qui combine musculation, activité cardiovasculaire modérée, alimentation riche en fibres et habitudes de vie saines.

Chaque élément de ce “package” contribue à la diversité et à l’équilibre du microbiote, qui lui-même influe sur la santé métabolique, immunitaire et même mentale. La musculation, bien qu’efficace pour renforcer les muscles et améliorer la composition corporelle, n’entraîne pas automatiquement un remaniement spectaculaire du microbiote intestinal prise isolément.

Néanmoins, ce type d’exercice fait partie d’un ensemble de facteurs qui, combinés, favorisent un environnement intestinal plus riche et plus résilient.

La recherche continue d’explorer ces interactions, et elle nous rappelle que la santé du microbiote dépend autant des habitudes alimentaires et du style de vie que de l’exercice lui-même.