Les bactéries filamenteuses segmentées sont des micro-organismes au profil très particulier. Leur structure allongée, composée de segments rappelant un collier de perles, leur permet de s’accrocher à la paroi de l’intestin grêle grâce à de minuscules crochets situés à leur extrémité.
 

Connues depuis les années 1970, elles ont été observées chez de nombreuses espèces animales comme les souris, les rats, les poulets, les lapins, les poissons ou encore les porcs.

Chaque espèce semble héberger sa propre lignée de bactéries filamenteuses segmentées. En revanche, leur présence chez l’être humain demeurait jusqu’à présent difficile à démontrer de manière formelle.
 

Cette difficulté s’explique notamment par leur caractère extrêmement fragile. Ces bactéries ne survivent pas en présence d’oxygène et ne se développent que dans une zone très spécifique de l’intestin grêle, ce qui rend leur culture en laboratoire pratiquement impossible.

Face à l’impossibilité de les cultiver, les chercheurs ont adopté une approche différente. Ils ont analysé de vastes bases de données contenant des échantillons de microbiote collectés dans différentes régions du monde.
 

Cette recherche a permis d’identifier des prélèvements provenant de jeunes enfants au Mali qui semblaient contenir les bactéries recherchées. Les scientifiques ont alors obtenu l’accès à ces échantillons afin de poursuivre leurs investigations.
 

L’analyse de l’ADN a permis de reconstituer deux génomes distincts.

Les chercheurs ont ensuite confirmé leurs résultats grâce à la microscopie électronique, qui a révélé des filaments présentant les mêmes caractéristiques morphologiques que celles observées chez les animaux, notamment les structures en forme de crochet permettant leur fixation à l’intestin.
 

Cette double validation génétique et visuelle a permis de confirmer officiellement leur présence chez l’être humain.

La bactérie identifiée a reçu le nom scientifique d’Anisomitus miae. Cette découverte marque l’entrée officielle des bactéries filamenteuses segmentées dans la liste encore limitée des espèces composant le microbiote humain.
 

Pour les chercheurs, cette identification constitue une étape majeure. Elle permettra désormais de rechercher plus facilement cette bactérie dans d’anciennes bases de données et dans de futurs travaux consacrés au microbiote intestinal.

Chez la souris, les bactéries filamenteuses segmentées jouent un rôle essentiel durant les premières étapes de la vie. Elles colonisent temporairement l’intestin au moment du sevrage, lorsque l’alimentation passe du lait maternel aux aliments solides.

Les études menées chez l’animal montrent qu’elles participent activement à la maturation du système immunitaire, contribuant à l’apprentissage des mécanismes de défense de l’organisme.

Les scientifiques cherchent désormais à déterminer si elles remplissent une fonction similaire chez l’être humain et si elles interviennent dans le développement de l’immunité dès les premières années de vie.

Les recherches réalisées chez les modèles animaux montrent toutefois que l’action de ces bactéries ne serait pas exclusivement bénéfique.
 

Lorsqu’elles deviennent trop nombreuses ou persistent plus longtemps que prévu dans l’intestin, elles peuvent favoriser certaines réactions immunitaires excessives.

Plusieurs études ont notamment observé une aggravation de maladies inflammatoires dans certains modèles expérimentaux, notamment liés à la maladie de Crohn ou à la sclérose en plaques.
 

Les chercheurs souhaitent donc comprendre si cette double facette existe également chez l’être humain.

Les bactéries filamenteuses segmentées pourraient ainsi agir à la fois comme des alliées indispensables dans la construction du système immunitaire et, dans certaines circonstances, contribuer à des déséquilibres inflammatoires.